En 1914 paraît une ''Histoire des mathématiques au Japon'' écrite avec l'historien américain des mathématiques David Eugene Smith. Elle est suivie par d'autres monographies, mais parues seulement en japonais. Dans une série d'essais parus dans les années 1930, il s'intéresse particulièrement au mathématicien Seki Takakazu.
Après les premières approches du missionnaire britannique Alexander Wylie, Mikami est celui qui a donné à l'Occident une connaissance approfondie de l'histoire chinoise des mathématiques. Ses livres sur les mathématiques japonaises sont des œuvres classiques.